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用于鉴定金黄色葡萄球菌的16S rRNA 序列片段的筛选和验证

首发时间:2020-06-19

周丹 1   

周丹(1995-),女,硕士研究生,主要研究方法:细菌传感器的研制与应用

何凤姣 1   

何凤姣(1964-),女,教授、博导,主要研究方向:细菌传感器的研制与应用

  • 1、湖南大学化学化工学院,长沙 410082

摘要:金黄色葡萄球菌(S. aureus)广泛分布,可导致多种严重的感染。因此,S. aureus的准确检测和鉴定已成为医学诊断,食品安全,环境卫生的重要环节。然而,当前缺乏同时具备丰度高、种内普适性好、菌间和菌外特异性好、易测量的理想靶标,影响了S. aureus检测速度和准确度。为了获得理想的S. aureus检测靶标,本文构建了一种用于筛选S. aureus鉴定靶标的方法。利用细菌体内高丰度的16S rRNA为研究对象,以种内普适性、菌间和菌外特异性、杂交效率等为评价指标,筛选出能鉴定S. aureus的16S rRNA序列片断,并利用PCR和电泳技术验证了该靶标的可行性。虽然我们只针对S. aureus检测靶标进行了筛选,但该方法对其他细菌也适用,有望在细菌种鉴定靶标设计中得到广泛应用。

关键词: 金黄色葡萄球菌 16S rRNA 鉴定靶标

For information in English, please click here

Screening and verification of species-specific 16S rRNA fragments for the identification of S.aureus

ZHOU Dan 1   

周丹(1995-),女,硕士研究生,主要研究方法:细菌传感器的研制与应用

HE Fengjiao 1   

何凤姣(1964-),女,教授、博导,主要研究方向:细菌传感器的研制与应用

  • 1、Chemisitry and Chemical Engineering School, Hunan University, Changsha, 410082

Abstract:S.aureus is a widely distributed pathogen that causes many infectious diseases. Thus, the identi?cation and quantitation of S. aureus have become a crucial point in medical diagnosis, food safety, environmental hygiene, and drug discovery. However, the lack of ideal targets with high abundance, good intraspecies universality, good interspecies specificity, and easy measurement has affected the accuracy of S. aureus detection methods. In order to obtain the ideal target, this article uses 16S rRNA with high abundance in the bacteria as the research object, Using the intra-species universality, interspecies specificity, hybridization efficiency and anti-interference ability as evaluation indicators, the 16S rRNA sequence fragment targets that can identify S. aureus species were selected and verified by PCR and electrophoresis technology. In summary, the ideal method for bacterial species identification can be obtained by using the constructed method, and this method has broad application prospects in the design of bacterial species identification targets.

Keywords: S. aureus 16S rRNA Identification target

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周丹,何凤姣. 用于鉴定金黄色葡萄球菌的16S rRNA 序列片段的筛选和验证[EB/OL]. 北京:中国manbetx体育在线 [2020-06-19]. https://www.0gl55.com/releasepaper/content/202006-115.

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